婴幼儿便秘是小儿科医师门诊中常见的问题，也的确造成父母很大的困扰。婴幼儿便秘首先要排除器质性便秘，也就是器官有问题所造成的便秘。一般而言，如果宝宝自出生开始就不易解便，或是有延迟解出胎便（出生超过48小时）的情形；或是腹部持续性地摸到肿块；或是合并其他症状，例如呕吐或是生长发育迟缓等等，都要特别警觉是否有「器质性便秘」。
在器质性便秘中，有一种病叫先天性巨结肠症，它的病因是某段肠子缺乏神经节，因而经常处于收缩状态，失去了蠕动的功能，无法排出大便而造成严重的便秘。这类便秘通常在新生儿时期就会出现症状，但也有可能过了新生儿期才被有经验的医师诊断出来。
另外，内分泌有问题，例如甲状腺功能低下症，或是腹部肿瘤压迫了肠道，都会造成便秘。器质性的便秘，症状多半是与日俱增，不会自行缓解，必须尽速请小儿科医师诊治。
